Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ogfod1Q3U0K8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ogfod1Q3U0K8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ogfod1Q3U0K8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ogfod1Q3U0K8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ogfod1Q3U0K8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ogfod1Q3U0K8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms