Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Hbq1bQ3U0A6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Hbq1bQ3U0A6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Hbq1bQ3U0A6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Hbq1bQ3U0A6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Hbq1bQ3U0A6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Hbq1bQ3U0A6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Hbq1bQ3U0A6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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Hbq1bQ3U0A6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hbq1bQ3U0A6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Hbq1bQ3U0A6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Hbq1bQ3U0A6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Hbq1bQ3U0A6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hbq1bQ3U0A6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hbq1bQ3U0A6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms