Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc28Q3TX51 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc28Q3TX51 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc28Q3TX51 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms