Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTL0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTL0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTL0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTL0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTL0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTL0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTL0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TTL0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TTL0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TTL0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TTL0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms