Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21440Q3TTD8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21440Q3TTD8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms