Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afvQ3THW5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2afvQ3THW5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms