Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Colec11Q3SXB8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colec11Q3SXB8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colec11Q3SXB8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms