Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col24a1Q30D77 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col24a1Q30D77 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col24a1Q30D77 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms