Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpne9Q1RLL3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpne9Q1RLL3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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