Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Vps8Q0P5W1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Vps8Q0P5W1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Vps8Q0P5W1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vps8Q0P5W1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms