Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cass4Q08EC4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cass4Q08EC4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms