Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q08AU9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q08AU9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q08AU9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q08AU9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q08AU9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q08AU9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q08AU9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q08AU9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q08AU9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q08AU9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q08AU9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q08AU9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q08AU9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q08AU9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q08AU9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q08AU9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q08AU9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q08AU9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q08AU9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q08AU9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q08AU9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q08AU9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q08AU9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q08AU9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q08AU9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q08AU9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q08AU9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q08AU9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q08AU9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q08AU9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q08AU9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q08AU9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q08AU9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q08AU9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q08AU9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q08AU9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q08AU9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q08AU9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q08AU9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q08AU9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q08AU9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q08AU9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q08AU9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q08AU9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q08AU9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms