Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm3Q08189 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tgm3Q08189 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgm3Q08189 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgm3Q08189 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms