Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn2Q08093 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cnn2Q08093 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnn2Q08093 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnn2Q08093 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms