Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MestQ07646 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MestQ07646 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MestQ07646 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MestQ07646 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MestQ07646 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MestQ07646 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MestQ07646 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MestQ07646 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MestQ07646 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MestQ07646 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MestQ07646 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MestQ07646 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MestQ07646 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MestQ07646 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MestQ07646 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MestQ07646 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MestQ07646 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MestQ07646 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MestQ07646 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MestQ07646 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MestQ07646 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MestQ07646 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MestQ07646 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MestQ07646 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MestQ07646 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MestQ07646 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MestQ07646 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MestQ07646 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MestQ07646 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MestQ07646 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MestQ07646 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MestQ07646 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MestQ07646 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MestQ07646 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MestQ07646 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MestQ07646 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MestQ07646 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MestQ07646 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MestQ07646 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MestQ07646 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MestQ07646 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MestQ07646 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MestQ07646 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MestQ07646 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MestQ07646 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MestQ07646 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MestQ07646 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MestQ07646 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MestQ07646 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MestQ07646 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MestQ07646 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MestQ07646 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MestQ07646 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MestQ07646 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MestQ07646 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MestQ07646 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MestQ07646 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MestQ07646 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms