Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nfe2Q07279 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nfe2Q07279 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nfe2Q07279 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms