Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aplp2Q06335 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Aplp2Q06335 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Aplp2Q06335 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aplp2Q06335 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms