Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Thbs3Q05895 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs3Q05895 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs3Q05895 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms