Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox10Q04888 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sox10Q04888 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox10Q04888 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms