Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkbQ04447 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkbQ04447 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CkbQ04447 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CkbQ04447 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkbQ04447 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkbQ04447 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkbQ04447 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CkbQ04447 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkbQ04447 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CkbQ04447 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms