Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RelaQ04207 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RelaQ04207 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RelaQ04207 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RelaQ04207 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RelaQ04207 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelaQ04207 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms