Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnb1Q03717 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnb1Q03717 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnb1Q03717 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms