Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Runx1Q03347 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Runx1Q03347 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Runx1Q03347 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms