Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfiaQ02780 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NfiaQ02780 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfiaQ02780 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms