Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ank1Q02357 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ank1Q02357 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ank1Q02357 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ank1Q02357 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms