Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ly9Q01965 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ly9Q01965 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms