Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RykQ01887 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RykQ01887 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RykQ01887 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RykQ01887 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RykQ01887 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RykQ01887 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RykQ01887 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RykQ01887 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RykQ01887 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RykQ01887 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RykQ01887 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RykQ01887 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RykQ01887 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RykQ01887 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RykQ01887 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RykQ01887 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RykQ01887 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RykQ01887 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RykQ01887 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RykQ01887 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RykQ01887 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RykQ01887 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RykQ01887 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RykQ01887 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RykQ01887 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RykQ01887 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RykQ01887 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RykQ01887 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RykQ01887 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RykQ01887 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RykQ01887 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RykQ01887 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RykQ01887 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RykQ01887 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RykQ01887 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RykQ01887 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RykQ01887 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RykQ01887 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RykQ01887 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RykQ01887 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RykQ01887 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RykQ01887 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RykQ01887 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RykQ01887 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RykQ01887 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RykQ01887 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RykQ01887 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms