Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col1a2Q01149 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col1a2Q01149 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col1a2Q01149 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms