Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scn1bP97952 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scn1bP97952 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms