Protein–RNA interactions for Protein: P97298

Serpinf1, Pigment epithelium-derived factor, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinf1P97298 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Serpinf1P97298 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Serpinf1P97298 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpinf1P97298 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms