Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim43bP86448 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim43bP86448 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim43bP86448 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim43bP86448 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim43bP86448 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim43bP86448 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim43bP86448 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim43bP86448 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim43bP86448 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim43bP86448 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim43bP86448 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms