Protein–RNA interactions for Protein: P86050

Tmem170b, Transmembrane protein 170B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem170bP86050 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem170bP86050 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem170bP86050 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem170bP86050 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms