Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hist1h3bP84228 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hist1h3bP84228 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hist1h3bP84228 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hist1h3bP84228 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hist1h3bP84228 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hist1h3bP84228 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hist1h3bP84228 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hist1h3bP84228 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 424.2 ms