Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gfi1P70338 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfi1P70338 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms