Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtgdrP70263 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtgdrP70263 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms