Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chl1P70232 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chl1P70232 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chl1P70232 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chl1P70232 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chl1P70232 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chl1P70232 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Chl1P70232 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chl1P70232 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chl1P70232 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chl1P70232 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chl1P70232 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chl1P70232 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chl1P70232 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms