Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig1P70193 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig1P70193 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms