Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capza3P70190 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capza3P70190 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capza3P70190 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capza3P70190 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capza3P70190 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capza3P70190 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms