Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcbP68404 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcbP68404 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms