Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abce1P61222 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abce1P61222 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abce1P61222 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abce1P61222 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Abce1P61222 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abce1P61222 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms