Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm2P58774 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm2P58774 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms