Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp1P58466 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms