Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Strn4P58404 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Strn4P58404 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Strn4P58404 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Strn4P58404 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Strn4P58404 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Strn4P58404 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Strn4P58404 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Strn4P58404 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Strn4P58404 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Strn4P58404 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Strn4P58404 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Strn4P58404 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms