Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox17P56394 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox17P56394 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms