Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd3P55096 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Abcd3P55096 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Abcd3P55096 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms