Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rad23bP54728 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rad23bP54728 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad23bP54728 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad23bP54728 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms