Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab2aP53994 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab2aP53994 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab2aP53994 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms