Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2e3P52483 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2e3P52483 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms