Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa10P50708 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa10P50708 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa10P50708 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms