Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpdP50404 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpdP50404 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpdP50404 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpdP50404 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpdP50404 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms